由威尔·康奈尔医学院(Weill Cornell Medicine)的研究人员领导的一个跨国团队开发了一种测试方法，可以帮助测量主要在非洲发现的病毒株感染者体内的艾滋病毒持久性——这是寻找治愈艾滋病毒的重要工具，将使全世界的患者受益。
这项研究发表在7月2日的《自然通讯》上，有助于填补人类免疫缺陷病毒(HIV)研究的主要空白。大多数艾滋病毒研究都集中在西方国家传播的病毒株上，主要是在与感染b亚型的男性发生性关系的男性中传播的病毒株。很少有研究调查在非洲传播的病毒株，在非洲，妇女受到的影响不成比例。
“艾滋病毒治疗研究往往侧重于在发达国家流行的病毒株，但是为了实现全球适用的治疗，我们必须研究影响世界其他地区的病毒株，”该研究的主要作者、传染病部医学病毒学助理教授、威尔康奈尔医学院微生物学和免疫学助理教授Guinevere Lee博士说。
研究结果表明，与发达国家的其他研究一样，在非洲传播的HIV毒株在人体内建立了病毒库。尽管抗逆转录病毒疗法可以将血液中的艾滋病毒水平降低到无法检测到的水平，但这些休眠的病毒库继续存活。它们含有大量有缺陷的原病毒DNA基因组，不能产生新的传染性病毒，但少数基因组在基因上保持完整，如果抗逆转录病毒治疗中断，它们随时准备产生活性病毒。
很大比例的缺陷病毒基因组使研究人员无法准确量化完整原病毒的拷贝数。“我们正在大海捞针:为了治愈艾滋病毒，我们首先需要找出在抗逆转录病毒治疗期间是否有基因组完整的原病毒留在体内。我们的新实验可以让我们做到这一点。然后我们需要瞄准并消除能够产生新病毒的完整前病毒DNA，”李博士解释说。
用一种新的检测方法拓宽HIV研究的视野
李博士和她的同事分析了乌干达接受抗逆转录病毒治疗的16名女性和7名男性的免疫细胞CD4+ T细胞的DNA，这是病毒DNA隐藏的地方。病毒的基因测序揭示了两种主要的HIV-1亚型:A1和D(一种众所周知的侵袭性毒株)。该研究还发现了A1和D的病毒杂交。
然后，该团队修改了现有的实验室检测方法，用于识别HIV亚型B前病毒，以检测亚型A1和D前病毒。李博士说:“我们开发的新检测方法将帮助研究人员专注于与受这些研究毒株影响的患者的HIV治愈研究相关的完整前病毒基因组。”
李博士和她的跨国、多机构合作伙伴已经在使用这种新的分析方法来研究乌干达病毒的长期持久性。他们的发现表明，HIV前病毒基因组景观的组成在A1、D和B亚型之间具有广泛的可比性，这表明针对非洲完整HIV储存库的方法将面临与北美和欧洲类似的“大海捞针”的挑战。未来的研究还需要评估非b亚型的差异，以了解亚型特异性因素是否影响病毒库中的持久性、再激活或清除。
该论文的资深作者包括美国国立卫生研究院国家过敏和传染病研究所的Andrew Redd博士，以及加拿大西部大学微生物学与免疫学和流行病学与生物统计学助理教授Jessica Prodger博士。
来自加拿大西蒙弗雷泽大学的研究人员;加拿大不列颠哥伦比亚省艾滋病毒/艾滋病卓越中心;乌干达Rakai健康科学项目;南非开普敦大学;约翰霍普金斯大学医学院也参与了这项研究。
美国国立卫生研究院正在通过推进艾滋病治疗研究企业(REACH)马丁·德莱尼合作实验室资助这项工作，该合作实验室由医学免疫学副教授、威尔康奈尔医学院微生物学和免疫学副教授布拉德·琼斯博士和玛丽娜·卡斯基博士共同领导，洛克菲勒大学临床研究教授，威尔·康奈尔医学院医学副教授，纽约长老会/威尔·康奈尔医学中心传染病主治医师。REACH实验室是美国国立卫生研究院资助的10个全球合作研究小组之一，致力于寻找治愈艾滋病的方法。
这项工作得到了国家过敏和传染病研究所校内研究部和美国国立卫生研究院拨款R21AI150398, R01AI162221和UM1AI164565的部分支持。
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